Chi phí vận hành logistics xanh cao hơn, dẫn đến giá dịch vụ có thể phải điều chỉnh. Điều này tạo ra áp lực lớn khi không phải khách hàng nào cũng sẵn sàng trả phí cao hơn cho dịch vụ thân thiện với môi trường. Trong khi đó, tại Việt Nam, chi phí logistics tại các doanh nghiệp bán lẻ chiếm tỷ trọng từ 10-20% tổng chi phí, trong đó chi phí vận tải chiếm tới 60-80%.